差分
この文書の現在のバージョンと選択したバージョンの差分を表示します。
| seminar:波動関数 2013/05/28 13:06 | — 現在 | ||
|---|---|---|---|
| ライン 1: | ライン 1: | ||
| - | ====== 波動関数の描画 ====== | ||
| - | ===== 一酸化炭素の計算 ===== | ||
| - | - 過去の大きさをちょっと大きめにする。 | ||
| - | - 計算する状態の個数をちょっと多めにする。 | ||
| - | |||
| - | ===== 出力ファイル名を指定して実行する ===== | ||
| - | <code text> | ||
| - | calc = Dacapo() | ||
| - | . | ||
| - | . | ||
| - | . | ||
| - | calc.SetNetCDFFile('tekitou_na_namae.nc') | ||
| - | calc.SetTxtFile('tekitou_na_namae.nc.text') | ||
| - | . | ||
| - | . | ||
| - | . | ||
| - | calc.Calculate() | ||
| - | </code> | ||
| - | |||
| - | ====== VESTA用ファイル作成法 ====== | ||
| - | Dacapoの出力ncファイルから波動関数可視化のためのVESTA用ファイルを作成する。必ず最新のVESTA.appを使用すること。 | ||
| - | |||
| - | - 適当なディレクトリを作り、そこにncファイルをコピーする\\ ただし、バンド分散の計算に使ったncファイルは使わないこと。電子状態の数×波数の数だけの大量のファイルができるので注意。<code sh> | ||
| - | $ | ||
| - | $ mkdir tekitou_na_directory | ||
| - | $ cp sakki_tukutta_file.nc tekitou_na_directory/ | ||
| - | $ | ||
| - | </code> | ||
| - | |||
| - | - ncファイルをコピーしたディレクトリにcdで移動し、getwfsを動かす。<code sh> | ||
| - | $ | ||
| - | $ cd tekitou_na_directory/ | ||
| - | $ ls | ||
| - | sakki_tukutta_file.nc | ||
| - | $ getwfs -a sakki_tukutta_file.nc sakki_tukutta_file.cube | ||
| - | GetWaveFunction: kpt = [-0.375 -0.375 0. ] | ||
| - | GetWaveFunction: kpt = [-0.375 -0.125 0. ] | ||
| - | ... | ||
| - | |||
| - | $ ls | ||
| - | sakki_tukutta_filek0.cube sakki_tukutta_filek1.cube ab33504k2.cube sakki_tukutta_filek3.cube sakki_tukutta_filek4.cube | ||
| - | ... | ||
| - | </code> | ||
| - | |||
| - | スーパーセルが斜方晶以外の場合（六法晶を含む）、cubeファイルから直接VESTA.appで描画することはできない。そこでcubeファイルをラッピングしたvestaファイルを作成する。 | ||
| - | |||
| - | - cubeファイルを一つ選び、makevestaを動かす。 | ||
| - | <code sh> | ||
| - | $ makevestafile -e ab33500k0.cube ab335.nc ab33500k0.vesta | ||
| - | $ ls ab33500k0.* | ||
| - | ab33500k0.cube ab33500k0.vesta | ||
| - | </code> | ||
| - | - できたcubeファイルとvestaファイルの両方をMacintoshに転送する。 | ||
| - | - 転送したcubeファイルとvestaファイルの両方を同じフォルダに置いた状態でVESTA.appにvestaファイルを食わせる。 | ||
